Dej druhej sezóny priamo nadväzuje na záverečný titul prvej sezóny "No Time Left" a udalosti DLC "400 Days". Ako bolo vidieť v záverečnej animácii predchádzajúceho dielu, príbeh druhej sezóny bude rozprávaný očami malého dievčatka Clementine, ktoré sa v mladom veku stalo sirotou v dôsledku epidémie, ktorá mení ľudstvo na krvilačné monštrá - zombie, ktorých sa ujal Lee Everett, hlavný hrdina predchádzajúcej sezóny. Clementinino dospievanie tak nebolo o školských laviciach a zlomyseľnosti, ale o neustálom boji o život, o živých mŕtvych roztrúsených po celej zemi a o nedostatku jedla a spánku.
Hráč bude opäť čeliť sérii morálnych rozhodnutí, príbehu s emóciami a rozmanitým cestám osudu, ktoré tvoria kostru celého deja. Nechýbajú ani staré dobré akčné (QTE) a adventúrne prvky prinášajúce množstvo vylepšení, či už v oblasti grafiky, zvuku alebo ovládania.
Celkovo bude v hre 5 kapitol, ktoré sa budú pridávať vo forme vylepšení.