Napriek takmer dokonalému záveru hry The Last of Us sa v úplne novom príbehu na pokračovanie opäť vraciame k postapokalyptickému príbehu otca a dcéry Joela a Ellie! Príbeh sa odohráva o niekoľko rokov neskôr a tentoraz sa ocitáme v úlohe pomstychtivej Ellie. Hráči zistia, že rovnako ako prvý diel, aj tento je nabitý emóciami, ale tentoraz nebude príbeh o láske, ale o nenávisti. Obľúbená postava prechádza premenou, jej ruky sú zjazvené, na zemi vidíme mŕtvolu a sme tiež svedkami rozhovoru, v ktorom sa dozvedáme, koho ľudí plánuje hrdinka zabiť.