Hra Spec Ops: The Line sa odohráva v srdci zničeného Dubaja. Dubaj, kedysi miesto bohatej elity, sa stal obeťou série ničivých piesočných búrok. Ultramoderná architektúra leží napoly pochovaná pod tonami piesku. A práve tento piesok bude v priebehu hry zohrávať významnú úlohu v bojových situáciách, či už vám pomôže, alebo bude prekážať.
Zatiaľ čo väčšina ľudí utiekla z tejto spustošenej pustatiny skôr, ako sa ňou stihli prehnali piesočné búrky, plukovník americkej armády John Konrad a jeho verná jednotka zostali, aby chránili tých, ktorí odísť nemôžu. Keďže sa po údere búrky nemohli nikomu dovolať, americká armáda sa obávala, že plukovník Konrad a jeho tím sú mŕtvi, až kým nezaznel slabý signál, a tak sa začala záchranná operácia.
Ako kapitán Martin Walker budete musieť so svojím tímom Delta Force preniknúť do zradnej oblasti a priviesť Konrada späť domov. Prekročte hranicu, kde sa smrť a povinnosť spájajú. Je to koniec - váš aj vášho zdravého rozumu - keď sa vaša služba skončí a toto je všetko, čo vám zostane.