V ďalekej budúcnosti bol v ľudskom mozgu objavený psionický hormón, ktorý ľuďom umožňuje získať mimozmyslové schopnosti a zmeniť celý známy svet. Keď ľudstvo vstúpilo do novej éry, objavili sa mutanti známi ako Tí druhí, ktorí majú chuť na ľudský mozog. Mutanti sú veľmi odolní voči bežným zbraniam, preto sa v boji proti tejto dovtedy nevídanej hrozbe pre ľudstvo prijímajú špeciálne opatrenia. Scarlet Nexus je nádherne štylizovaná akčná hra s neotrelým bojovým systémom plným nadprirodzených schopností.
Používanie psychicko-kinetických schopností sa stalo najväčšou zbraňou na celom svete. Zdvíhanie, rozbíjanie a hádzanie kúskov prostredia s cieľom vytvoriť silné útoky a kombá sú jediným spôsobom, ako poraziť mocného nepriateľa.
Z nebies zostúpili zlomyseľní mutanti, vysoko odolní voči bežným útokom a obranným prostriedkom, odhodlaní narobiť vo svete spúšť. Kvôli mutácii sú v neustálej agónii, a tak hľadajú mozgy živých organizmov, aby skrotili svoje šialenstvo. Táto futuristická Japonka spája inšpiráciu klasickým anime a západným sci-fi do žánru nazvaného Bran Punk.
V hre sa ujmete úlohy Yuita Sumeragiho z Other Suppression Force (OSF). Postupne sa vybavíte svojimi psychokinetickými schopnosťami, preskúmate futuristické mesto New Himuka a odhalíte tajomstvá budúcnosti Brain Punku. Za príbehom stoja ľudia, ktorí vytvorili hru Tales of Vesperia, takže sa môžete tešiť na komplexný príbeh plný odvahy, hrdinstva a medziľudských vzťahov.