Prevezmete úlohu Nathana Frosta, ktorý slúži ako dobrý vojak pre Koalíciu slobody. Hra sa odohráva v blízkej budúcnosti, ktorá nás všetkých zatiaľ čaká, konkrétne v roku 2065. Nie ste len tak hocijaké orezávadlo a môžu za to udalosti, ktoré vás doposiaľ postihli. Vaše poškodenia boli napravené pomocou nanotechnológie, ktorá vám dala mimoriadne schopnosti. Keď bojujete proti deštruktívnemu režimu, vaši nadriadení vás nechávajú na nepriateľskom území samého. Vy si však uvedomujete vážnosť situácie a s myšlienkou, že niekde sa šialenec chystá použiť superničivú tajnú zbraň, sa ho vydáte vypátrať a zlikvidovať. Zápletka teda nepatrí k najoriginálnejším a o jej chytľavosti by sa tiež dalo diskutovať, ale hra bude mať niekoľko vecí, v ktorých bude vynikať.