Príbeh sa začína, keď sa zázračné dieťa Sorata Suzuhara zatúla po vypočutí záhadnej piesne a omdlie. Keď sa prebudí, zistí, že sa ocitol v minulosti. Na tomto neznámom a čudnom mieste čoskoro stretne dievča, ktoré mu povie, že preskočil čas, a čoskoro mu sľúbi, že mu pomôže dostať sa domov.
Sorata nasleduje záhadné dievča na okrúhlu vzducholoď menom Norn, ktorá lieta pomocou technológie, akú si nevie predstaviť. Na tejto vzducholodi sa stretáva s tromi mladými dámami a deviatimi mladými mužmi, ktorí majú jedinečné schopnosti a sú na ceste, ktorú im určil muž zvaný "Svet".
Odhaľte tajomstvá lode a jej obyvateľov z pohľadu každej z troch dievčat, komunikujte s ostatnými postavami a sledujte, ako reagujú na konkrétne situácie. Zažite cestu a iný príbeh, keď hráči rozhodujú o osude postáv v rozvetvenom príbehu. Hrajte viackrát, aby ste odomkli skutočný koniec príbehu, čo pridáva zmysluplnú hodnotu opakovaného hrania.
Znovu prežite radostné chvíle v hre Norn9: Var Commons s režimom galérie, zapájajte sa do herných úloh a zbierajte body, aby ste odomkli ďalšie bonusy a špeciálne funkcie.