Marvel's Avengers sa začínajú v deň A, keď Kapitán Amerika, Iron Man, Hulk, Čierna vdova a Thor odhalia high-tech sídlo Avengers v San Franciscu - vrátane vlastného helikoptérového lietadla poháňaného experimentálnym zdrojom energie. Oslava sa však strašne zvrtne, keď katastrofálna nehoda spôsobí obrovskú deštrukciu. Vinu za túto tragédiu nesú Avengers, ktorí sa rozpadnú. O päť rokov neskôr, keď sú všetci superhrdinovia postavení mimo zákona a svet je v nebezpečenstve, je jedinou nádejou znovu zhromaždiť najmocnejších hrdinov Zeme.

Hra Marvel's Avengers prinesie pravidelné aktualizácie obsahu a vezme hráčov na epickú výpravu, ktorá bude trvať niekoľko rokov. Táto hra predstavuje budúcnosť značky Avengers.