V hre Far Cry 3 sa ocitnete v úlohe Jasona Brodyho, muža, ktorý stojí sám na okraji sveta na tajomnom tropickom ostrove odrezanom od civilizácie. V tomto brutálnom raji, kde sú zločin a násilie jedinými istotami, budete rozhodovať o tom, kedy a ako sa budú udalosti hry vyvíjať.
Za hranicami civilizácie sa nachádza ostrov, kde neplatia žiadne zákony. Je to miesto, ktorému vládne pirátstvo a ľudské utrpenie a z ktorého niet úniku inak ako drogami alebo guľkou do hlavy. A práve tu sa ocitnete vy. Uviazli ste na mieste, ktoré nepozná dobro od zla, na mieste, kde vládnu princípy násilia.